Johnny passe son enfance à Port Royal avec Anne, sa mère. Les rues de la colonie sont peuplées d'aventuriers, de malfrats et de femmes de mauvaise vie. Se sentant étranger à cet univers, le garçon rêve de partir, mais la santé fragile de sa mère l'oblige à passer outre. Contraint de travailler pour Bennet Avery, un charpentier, Johnny essaie de s'en sortir jour après jour, allant même jusqu'à remplacer Anne, dans l'auberge de Bartholomé, pour qui elle travaille. Pendant ce temps, le gouverneur de Port Royal, Henry Morgan, de connivence avec le corsaire Woodes Rogers, orchestre l'exécution du pirate Emmanuel Wynne, unique survivant d'une désastreuse expédition dans le Triangle du Diable à la recherche d'un mystérieux trésor. Johnny assiste à la pendaison avec Avery et se rend compte que le charpentier semble connaître le pirate. Pendant cette même soirée, écoutant une conversation entre ce dernier et Bartholomé, il apprend la vérité ces deux-là étaient des pirates, cachés à Port Royal pour fuir les autorités. Le premier faisait partie de l'équipage d'Edward Teach, également connu sous le nom de Barbenoire. Il découvre en outre que le trésor existe et que l'oeil de verre d'Emmanuel Wynne peut révéler son emplacement exact. Ainsi, il décide d'en savoir plus et se laisse convaincre par Avery d'exhumer le cadavre et de récupérer l'oeil de verre. La mission est une réussite et Johnny se rend compte que l'oeil n'est pas seulement un oeil postiche, mais une relique magique qui lui permet de voir ce que son possesseur a vu par le passé à travers de violentes visions. Alors qu'il est à la merci de l'une de ces visions, Port Royal est attaquée par Barbenoire, décidé lui aussi à récupérer l'oeil. Avery, pour sauver leurs vies, choisit de s'enrôler à nouveau dans l'équipage, entraînant le garçon avec lui. Bien vite, Johnny sera confronté à la dure vie à bord, apprenant à se battre et essayant de survivre à un voyage en mer qui lui attirera les mauvaises grâces du second capitaine, Victor Hardraker, un traître complotant dans le dos de Barbenoire pour s'emparer du trésor. Il partira à la recherche d'une tribu de cannibales. Il y rencontrera le sorcier du village et sa petite-fille, N'ahele, tous deux à l'origine de la création de l'oeil d'Emmanuel Wynne. Ils se proposent d'aider l'équipage de Teach. Toutefois, les pirates, après avoir appris ce qui les intéressaient, trahiront les indigènes et enlèveront N'ahele, pour l'obliger à les guider vers le Triangle du Diable. Johnny prendra soin d'elle et entre les deux jeunes gens, naîtra un sentiment d'affection mutuelle. Ensemble, ils atteindront l'île sur laquelle le trésor est caché, découvrant une amulette capable d'exaucer les souhaits. Mais la trahison de Hardraker mènera à la mort de l'indigène. Après s'être vengé du second capitaine, Johnny retournera à bord du Queen Anne's Revenge pour découvrir une autre réalité catastrophique: le corsaire Woodes Rogers les a suivi pendant tout le voyage et a abordé le navire, avec l'intention de tuer Teach (pour sa vengeance personnelle) et de récupérer l'amulette afin d'exprimer son désir de devenir Roi d'Angleterre. Pendant la bataille qui s'en suit, Johnny est blessé mortellement et, après avoir vu tomber Barbenoire sous le feu ennemi, grâce à l'amulette, il exprime, grâce à l'amulette, son désir de vouloir survivre. Douze ans plus tard, un mystérieux pirate entre dans l'auberge de Bartholomé, désormais vieux, et s'assoie à la table de l'unique client restant, un Woodes Rogers mal en point et tombé en disgrâce après ces événements. Le pirate se révèle être Johnny, désireux de se venger du corsaire.